除藻剂对硝化细菌有影响，一旦使用过量就会导致硝化细菌大批死亡，从而影响整个鱼缸的生态平衡。除藻剂一般是用来消灭藻类的，但它并不是只会除藻，缸内的其它生物也会受到影响，因此为了避免别的生物被危害，一定要控制好它的用量，每次不能用太多。
1、选择药物：使用除藻剂首先要注意选择，市面上常见的除藻剂有两种，分别是戊二醛和硫酸铜，它们的除藻效果都很不错，因此用哪个都可以，但要注意的是，二者不能一起用，因为它们会发生反应，从而丧失原本的药效。
2、注意用量：正如上面提到的，除藻剂过量会有一定的危害，所以控制它的用量极为关键。以戊二醛为例，通常每50升水里加入2%的药物就可以了，一旦过量就会影响缸内的其它生物，甚至会破坏硝化系统。
3、日常预防：除藻剂不仅可以除藻，同时也能起到预防的作用。和正常使用不同的是，预防藻类生长的话，浓度必须进一步减低，这样才不会对缸内的鱼类、水草等产生危害。
