想要清理鱼缸中的鱼屎，最好的办法就是在缸内安装一个水泵，让它把鱼的粪便抽走。首先要选对水泵的型号，太大容易溢流，太小则水流受限。其次要将吸水口缩短一点，这样可以增大吸力。需要注意的是，如果鱼屎会流到鱼缸的角落，就要将水泵旁边的氧气口打开，另外还要封上造流的喷氧口，这样一来，小口喷出的水流就可以将鱼便冲到吸水口了。
1、减少投喂：之所以鱼屎会多，主要原因还是投喂饲料太多，鱼类通常是比较耐饿的，喂的太多反而容易撑坏肠胃，导致它患病，而且残饵和鱼屎还会影响水质。所以从源头入手，需要减少平时的投喂，可以几天喂一次，每次喂到七八分饱即可。
2、定期换水：如果鱼缸中没有底砂，那么可以在换水的时候清理鱼屎。只要将水从缸底抽出，就可以将鱼屎和残饵清理掉，然后再从缸壁慢慢兑入新水就可以了。不过换水的时候一定要小心，不要将鱼从缸里抽出来。
3、养鱼清理：除了这些方法外，还可以通过养鱼的方式来清理。通常选择的是底栖类的清道夫，这种鱼可以将水底的残饵以及鱼便都吃掉，不过需要注意的是，由于是混养，所以鱼类的体形要接近，否则太小的鱼也会被它吃掉。
