黄头侧颈龟在跟鱼一起混养的时候，水中会有一些鱼屎，而黄头侧颈龟可以将鱼屎作为自己的食物。许多养殖者会觉得这些鱼屎没有营养，而且容易污染水质，所以不想将鱼跟黄头侧颈龟一起混养。其实，鱼屎中会含有一些动物性蛋白，这些营养物质对黄头侧颈龟的生长发育是有帮助的。不过，总体来看黄头侧颈龟是一种偏爱素食的龟类，所以需要将植物类的食物作为它们的主食。可以在容器中放一些水草，或者将家中的蔬菜作为它们主要的食物，蔬菜和水草、水藻等都是黄头侧颈龟爱吃的食物。
虽然黄头侧颈龟可以吃鱼屎，不过鱼屎毕竟会污染水质。所以可以时常观察一下，若是水中出现了大量的鱼屎，则需要及时清理掉，必要的时候还需要换水。若是水质太差的话，容器导致黄头侧颈龟生病。
黄头侧颈龟可以跟鱼一起混养，因为它们主要是吃素食的，一般不会将鱼类作为自己的食物吃掉。不过，为了避免意外的发生，在选择混养的鱼类时可以注意一下。首先，从体型方面来看，不能选择体型太小的鱼。另外，还需要选择活性高一些的、游动速度较快的鱼，这样的鱼不容易被吃掉。具体来说，可以选择珍珠鱼、鹦鹉鱼等品种。
