发现鱼甩籽的话，第一时间要用网将缸底的鱼籽捞出来。如果是配对繁殖的鱼，鱼籽可以长出幼鱼，但单只鱼甩籽的话，只会污染水体，导致水质恶化，所以需要及时处理。为了避免鱼籽粘在缸底不要清理，最好在甩籽前放一些假水草，好让鱼籽能够附着，这样清理起来也比较方便。
鱼籽最大的问题就是污染水质，为了避免水体恶化影响鱼儿的健康，可以定期换换水。需要注意的是，由于鱼在甩籽后身体虚弱，所以在换水前最好将其捞出单养，因为这个时候换水往往比较频繁，每次要换三分之一左右，对鱼体的刺激较大，不注意的话会导致母鱼死亡。
对于鱼籽，还有一种比较简单的清洁方式，就是等鱼自己吃，不过鱼吃的有限，可以养一些螺，让它们将鱼籽吃掉。不过一定要提前养，等到鱼籽甩出来再准备养就晚了。除了养螺外，还可以养一些虾或底栖的鱼类，也可能将鱼卵吃掉。
为了防止鱼籽对水体造成较大的污染，也可以在刷缸的时候将其清除。刷缸前一般要将鱼捞出单养，并将水全部倒掉，将鱼籽刷掉后，再重新养水，然后把鱼儿放回来。这种方式比较麻烦，但可以保证母鱼的存活。
