成年大鳄龟体重可达到70-90kg，身长可达到60-75cm。成年小鳄龟体重在20-35kg，身长在30cm-45cm。初生大鳄龟体重8-10g，初生小鳄龟体重7.2g左右，身长为3.3cm左右。在周围环境适宜的情况下，鳄龟就会成长得很快，体型就会较大。宽敞的空间是促进鳄龟生长的重要因素之一，适宜的温度，良好的水质，健康均衡的食物也会促进它们的成长。幼年大鳄龟生长速度较慢，而小鳄龟则相反，这或许与性格有关。它们生性懒散，吃食也不积极，而小鳄龟更活泼更擅长主动觅食。
鳄龟龟壳厚且长，它们的龟壳正常可达40cm，野生鳄龟最长可达70cm以上。龟壳上有三条棱突，整体呈棕褐色，龟壳有黄色，褐色，灰色条纹，头部呈三角形，有黄色条纹。它们的舌头呈鲜红色且有类似于蛇的分叉肉突，有利于诱导猎物。
这种龟四肢粗短，尾巴细长且坚硬有力。它们皮肤上有粒状硬块，腹面有鳞片，而区别于其他龟的重要一点是，遇到危险时，它们不能缩回壳里。成年鳄龟龟壳色深，有深褐色，黑褐色。它们的指间有蹼，爬行时速度较快，尾巴中间有一节明显的凸起。
