玛丽鱼属于杂食性鱼类，它主要以藻类和一些有机碎屑为食，所以大部分玛丽鱼都是食用绿藻的。在人工饲养的条件下，可以让其食用水族箱内的水草，以及水箱缸壁上生长的青苔或者绿藻。为了利于它的生长，保证其在生长阶段所需要的营养均衡，除了让其食用缸中的水草以及藻类，还需要定期地为其补充适量的动物性饵料。
此外，由于玛丽鱼有啄食的特性，在水质环境较差并且其嘴部受伤的情况下，极易患口霉病。为了减少这种情况的发生，在饲养的过程中需要保证水质环境的适宜，并且多留意其口部是否受伤。
玛丽鱼的除藻效果是比较好的。玛丽鱼的嘴部比较灵活，不像其它的工具鱼由于消化道的原因只能吸食藻类，它是可以啄食藻类的，一些比较顽固的藻类，通常可以靠玛丽鱼来解决。
此外，玛丽鱼还会清除缸中的油膜。一旦看到油膜，它们就会主动上前吃掉，将它们清理的很干净。
