蛇颈龟是深水龟,它们比较喜欢在深水中生活。但是幼年时期,它们的体型较小,而且体力和游泳的能力比较差,饲养者是不能用深水来养殖的,不然可能会出现呛水或者溺亡的情况。等它们成年以后,就可以用深水养殖。饲养者也可以定期增加高度,这样可以避免它们突然进入深水后出现不适。
蛇颈龟不同的体型以及不同的饲养阶段,所需要的水位高度也是不同的。正常来说,幼年时期的水位需要浅一些,因为幼年时期它们的体型较小,而且游泳能力和体力都比较差,饲养者可以将水位的高度与背甲的高度保持一致,这样它们的呼吸和活动都比较方面。随着它们体型的增加,水位的高度也可以增加。等它们发育成熟后,水位的高度可以控制背甲高度的2倍,最高不要超过3倍。
如果无法确定具体的水位,饲养者也可以用砂砾在容器内铺成一个斜坡,这样它们就可以自由的选择活动的水位。但是砂砾中容易藏匿垃圾和滋生细菌,饲养者需要勤换水,才能保证水质清洁。