在使用过滤棉的时候，需要注意放置的顺序问题。过滤层包含比较多的种类，比如物理过滤棉、生化棉、陶瓷环等等。在具体放置的时候，它们的位置是不同的，可以根据以下的步骤来放置它们：
1、最上层：最普通的物理过滤棉最好放在最上层。它们是用来过滤鱼缸中一些比较大的杂质。建议这种过滤棉放置两次，这样清洗的时候可以循环清洗，或者分开清洗，在清洗一层的时候另一层还可以使用。不过上面同样会带有一些硝化细菌，清洗的过程中需要稍微注意。
2、生化棉：在下面一层可以放置生化棉，它们一般来说不会特别脏，因此也不用经常清洗。
3、陶瓷环：陶瓷环可以放置在第三层。可以多放一些，它们改善水质的作用还是比较大，可以让它们占整个水体的3%-5%。
4、活性炭：还有一类比较特殊的就是活性炭。这种并不是必须使用的，若是水中出现腥味和臭味则可以考虑使用，其它情况下不使用也是可以的。
在使用过滤棉的时候，需要将它们放置在滤盒之中。若是滤盒之间每一层是隔断的，那么先放置哪一层都行。若是滤盒之间每一层并不隔断，那么可以从最下面的一层开始放置。
