1、品种不同：鳄龟是一个大的品种，它包含大鳄龟和小鳄龟。而佛鳄龟是小鳄龟下面的一个亚种，两者的品种不同。
2、背甲不同：佛鳄龟的背甲是长椭圆形的，前宽后窄，没有非常明显的隆起，但是尾部有明显的尾棘。与其它小鳄龟的背甲比较相似。但是与大鳄龟的背甲有很大的区别，大鳄龟的背甲有明显的棱脊，而且背甲有较高的突起。
3、外形不同：佛鳄龟的背甲颜色都是淡黄色的，其它品种的鳄龟颜色大都都是棕色或者褐色。佛鳄龟的颈部有比较明显的刺，而且头部大多都是白色的，其它品种的鳄龟颈部的刺很少，有些没有刺，并且其它品种的鳄龟头部大多都是黑色的。
1、背甲区别：纯佛鳄龟和杂佛鳄龟的颜色虽然比较相似，但是它们背甲的形状有很大的区别。纯佛鳄龟的背甲是长椭圆形的，杂佛鳄龟的背甲是扇形的。
2、眼睛不同：纯佛鳄龟的眼睛和鼻子的距离短，眼睛和鼻子的位置都是往上靠的。而且纯佛鳄龟的眼睛是十字纹的，没有杂点、杂佛鳄龟的眼睛和鼻子的位置距离较长，而且杂佛鳄龟眼睛的十字纹比较模糊，还有的会变成米字眼。
