1、准备孵化箱：鳄龟产蛋后就要孵化，现在一般都是采取人工孵化。孵化时首先要准备一个大小合适的孵化箱。箱子的最下方铺上一层泡沫板，但是泡沫板上要扎一个小孔。再铺上一层粗砂，最上面铺上2层细砂，最后将蛋放在砂子上就可以。要注意蛋与蛋之间的间隔要大一些。
2、控制孵化环境：鳄龟蛋在孵化的时候，需要保持孵化箱内的温度在28-30℃之间，湿度也要保持在81%-85%之间。砂子的含水量最好控制在7%-8%之间。
3、定期检查：孵化箱内的环境调整好后就可以开始孵化，在孵化期间，饲养者需要定期观察，如果发现砂子变白，就说明缺水了，此时要适当喷一些水。还要定期拿手电筒照一下鳄龟的蛋，避免有坏掉的影响其它的蛋。
刚孵化出的鳄龟腹甲上还有脐带，此时需要将它们放在砂子或蛭石上饲养几天，等它们的脐带脱落后，就可以放在水中饲养了。
刚出生的鳄龟不需要立即喂食，因为它们脐带上会有卵黄素，这些营养足够它们吸收一段时间。等它们吸收完后，再投喂一些小鱼、小虾的碎肉就可以。
