黄耳龟是深水龟，可以在深水中饲养。但是在幼年时期，是不能用深水来饲养的。因为它们刚出生不久，体力和游泳的能力都不强，而且对环境的适应能力也不好，饲养者最好将它们放在浅水中养殖。
等它们成年以后，就可以放在深水中生活了。因为它们本身就是深水龟，可以在偏深一点的水中生活。而且它们成年以后，体型和水性都会变强，所以等成年以后，是可以用深水来饲养黄耳龟的。
黄耳龟在不同的阶段适应的水位是不同的，幼年时期的黄耳龟水位需要浅一些，高度控制在背甲以下最好，这样它们一抬头或一踮脚就可以呼吸到新鲜的空气。
等它们体型长得大一些，就可以稍微提升一下水位的高度，高于背甲1-2厘米最好。因为它们的背甲，需要在深水中才能发育得更好。
等它们发育成熟后，就可以放在深水中饲养的。水位的高度可以控制在背甲高度的1.5-2倍之间。虽然它们是深水龟，但是水性还是不如纯水龟，饲养的水位也不要太高，以免出现呛水和溺亡的情况。
