迷你鹦鹉鱼下小鱼了以后最好不要分开，因为刚出生的迷你鹦鹉鱼不会觅食，需要吸引母体上的黏液生存。如果饲养者将亲鱼和小鱼分开，小鱼很有可能会因为不会觅食而饿死。一般情况下，小鱼出生7天左右，就会从亲鱼身上下来，自己尝试觅食和活动。所以在它们刚出生的时候，饲养者最好不要将小鱼和亲鱼分开，可以等小鱼起飞以后再尝试分开。
通常来说，迷你鹦鹉鱼出生3天左右就会甩尾，出生7天左右就会起飞，在它们起飞5天左右就可以自行觅食和活动了，所以饲养者可以在迷你鹦鹉鱼出生半个月左右将亲鱼和小鱼分开，因为此时它们已经从母体上下来，对外界的环境也有了一定的适应，此时分开对小鱼不会有太大的影响。如果饲养的密度较低，不分开也是可以的。
但是饲养密度较高的时候，就必须要分来。因为迷你鹦鹉鱼的领地意识比较强，如果饲养者不将亲鱼和小鱼分开，那么亲鱼很有可能会将小鱼吃掉。
