泥水养龟最容易遇到的就是底泥变臭，这是由于底泥缺氧，导致厌氧菌大量繁殖，它们分解食物残渣和粪便后会释放臭气。想要解决的话，需要种植一些水生植物，这样可以释放一定的氧气，抑制厌氧菌的生长。另外还要注意喂食的用量，少喂一点也能避免底泥发臭。
1、换水：泥水养龟是需要换水的，如果只是给它补充新水，水体中的有害物质就会逐渐累积，到达一定量后就会对乌龟造成毒害。值得一提的是，如果泥比较好，可以减少换水，但也不能不换。
2、放龟：泥水养龟一定要先建立好生态系统，之后才能放龟，而不是布局好环境立刻放。通常将泥水环境布置好后，需要静置一段时间，然后将水面的杂质捞出去，等待水沉淀。如果一周后，上层的水保持清澈，不会散发臭味，就可以放龟了。
3、选泥：泥水养龟并不是什么泥都可以用，如果用了污染较重的泥土，对乌龟的身体有极大的危害。通常用的是来自池塘的泥，这种泥本身就带有一定的有益菌，建立生态系统会比较容易一些。也可以用干净的黄泥，但要试用一段时间。
