鹦鹉鱼并非自然形成的鱼类，最早是用雄性红魔鬼鱼和雌性紫红火口杂交而成，因此这种鱼的雌雄之间的染色体是无法配对的，雄性无法使雌性受精，雌性产出的卵也就不能孵化。产卵后需要尽快将其处理掉，避免污染水质。如果鱼缸里有其它鱼类，可以放任其将鱼卵吃掉。
上面提到，雌雄鹦鹉鱼是不能繁殖后代的，但这并不代表其它鱼类不能。雌鱼可以和雄性的紫红火口、罗汉鱼等鱼类繁殖后代，其中和紫红火口杂交会生出金刚鹦鹉鱼，这种鱼的体型很雄壮，而且还能起头。和罗汉鱼杂交后，可以孵化出麒麟鹦鹉鱼。由于繁殖有不确定性，因此也可以获得很多造型各异的鱼类。
想要区分公母鹦鹉鱼，可以从外形和习性入手。公的颜色比较红，背鳍和臀鳍较长，有时可以超过尾鳍，生殖孔比较平滑，凸出的部分很小。母的颜色略淡，生殖孔的凸出比较明显，而且在产卵期，腹部还会膨胀。另外，公的有挖坑的天性，还比较好斗，因此更容易起头。而母的不挖坑，很少参与战斗，产卵前可能会起头。
