养殖巴西龟时，要特别注意所用的水的问题。为了保证水质干净，需要定期将水更换一下，不然水容易发臭，对巴西龟的生长发育也是不利的。不过，换水并没有一定的频率。若是水中有过滤器或者其他的净化装置，那么换水不用特别频繁，有时候10天甚至15天左右才需要换水一次。
不过，若是没有过滤器等装置的话，那么换水就需要频繁一些了，不能等到水质非常脏了之后再换。再者，换水的时候还得注意换水的量，不能将旧水完全倒掉，要留在一部分旧水，然后放入一部分新水。再者就是水位问题，水位是不能太高的，不然可能会影响巴西龟呼吸，刚刚没过它们的背部就比较合适。
养殖巴西龟不仅需要注意换水的问题，还需要注意所用水的种类问题。其实家中的自来水就是可以的，也比较方便。不过，不能用直接从水龙头上接下来的水，因为其中含有非常多的氯气，这种物质可能会刺激巴西龟的身体，导致它们感染一些病菌，不利于它们的健康。因此，在使用自来水之前尽量将它们放置一段时间，或者直接将其放置在太阳之下暴晒，这样对于除去氯气来说效果是更好的。一般来说，暴晒两三天就可以使用了。
