草龟分辨公母主要是看外表。公龟身材窄一点，母龟身材稍微宽一点，并且母龟显得更加圆润一些，并且母龟的体型要比公龟大；从腹部底板来看，由于生殖需要，公龟底板与母龟相比，有一处凹陷，并且底部花纹也比较稀疏；公龟的尾巴比较粗长，根部粗壮，而母龟的尾巴则比较细，看上去也比较短小；从泄殖孔来看，公龟的在尾巴处，形状大体是长的，而母龟的形状是圆形的；从外部颜色上看，公龟成年后身体会变成黑，也就是发生墨化现象，而母龟基本上没有这种变化。
草龟公母最好不要放到一起养。一旦饲养的环境比较适宜，草龟容易产生一定的领地意识。体型较大的草龟就会欺负体型比较小的草龟，这一点并不会因为性别而发生改变。并且它们也会因为抢食等发生争斗，公龟常常会啃咬母龟，因此最好不要放到一起养。如果有条件的话，平时可以分开养，等到发情期需要进行繁殖的时候可以再合到一起去。
