鱼有四个鳃。它的鳃盖有两片，掀开后就可以看到里面的鱼鳃，这是它的呼吸器官。当水流从口部进入后，会从鱼鳃流出，由于水流的方向和鳃丝中血液的流动方向相反，这样就能高效的从水中摄取氧气，同时还能排出二氧化碳。
1、鱼鳔：对于硬骨鱼来说，鱼鳔是改变身体密度的重要器官，这可以让它在水中上浮或下潜。但对一些比较特殊的鱼，比如非洲肺鱼来说，鱼鳔就是辅助呼吸器官。当河流进入枯水期后，鱼儿会暴露在空气中，这个时候它就需要用鱼鳔来呼吸了。
2、皮肤：弹涂鱼是一种可以脱离水后仍能存活的鱼类，依靠的就是皮肤的呼吸能力。这种鱼一般会在沿岸的浅水区生活，等到退潮后就会留在滩涂上，从而方便它进行觅食，借助胸肌柄甚至可以跳跃移动。
3、肠道：生活在泥里的泥鳅也是一种鱼，它在水体缺氧的时候也能到水面吞咽空气，因为它的肠道可以呼吸。另外在水池干涸后，它可以钻到湿泥里，只要保持体表湿润，它就不会死亡。
