海胆品种有很多，现有的品种有900多种。它们可以分为规则海胆亚纲和不规则海胆亚纲这两种，这两种亚纲中一共有22目，生种就有900多种，隶属224个属。我国已经发现的海胆种类就有100多种，另外，海胆还有7000多种化石种。
常见的海胆品种有马粪海胆、紫海胆、北海紫海胆、赤海胆、长刺海胆等。马粪海胆主要产自日本北海道以南的地区，直径一般在4厘米左右。它们的外壳刺比较短，但是比较密，颜色大多呈黄绿色。紫海胆是日本常见的海胆品种，它们的体型偏大，成年后的直径在5-7厘米之间，颜色为淡紫色。赤海胆颜色是红褐色的，但是它们产量比较稀少，市场上比较少见。
要想挑选好的海胆，首先就要选择一些嘴部丰满并且略微有突起的海胆，因为这种海胆是非常新鲜的。如果是嘴部下陷和颜色发暗的，就是不新鲜的。其次就是要选择比较肥美的海胆，一般海胆外面的刺又短又粗的就比较肥，刺细长的就偏瘦。最后就是要看颜色，海胆的种类有很多，五彩斑斓的海胆一般都是不能食用，只有常见的黑色或褐色的海胆才是可以食用的。
