1、科目不同：中华鲟是脊索动物门、硬骨鱼纲、鲟形目、鲟科、鲟属、中华鲟种的鱼类，清道夫是脊索动物门、辐鳍鱼纲、鲇形目、甲鲇科、下口鲇属、下口鲶种的鱼类。两者品种有很大的区别。
2、外形不同：中华鲟的体型是纺锤形的，它们的头部比较尖，吻部也比较长。它们的体表被五行鳞片覆盖，这些鳞片又硬又大。清道夫鱼体呈流线型，眼睛比较小，而且嘴巴在身体的下方。
3、习性不同：中华鲟主要生活在大江和近海中，它们喜欢在水底活动，有洄游性和半洄游性。它们主要以小鱼、小虾或者是水底的微生物为食物，属于肉食性的鱼类。清道夫虽然也是在底层活动，但是它们主要生活在小溪、湖泊中，喜欢以水藻和青苔为食。
清道夫和中华鲟鱼不能一起养，因为首先中华鲟鱼的体型偏大，清道夫的体型偏小，两者的体型差异较大。其次就是它们的习性不同，中华鲟比较喜欢吃肉类和小鱼、小虾等食物，清道夫则喜欢吃一些青苔、水藻等，两者对食物的要求不高。最后就是它们的性格不同，清道夫的性格比较温和，中华鲟的性格则比较凶猛。
