金枪鱼属于鱼类，而且是一类硬骨鱼。鱼类一般都是有鳞的，金枪鱼也有鳞。不过它们的鳞片已经有一定程度的退化，变为了很小的圆鳞，也比较细，它们的排列比较密集，也比较厚。这样的鱼鳞可以让它们的游动速度更快。不过，它们胸部的鱼鳍相对来说会大一些，这是保护它们自身的重要构造。金枪鱼的鱼鳞是不能吃的，它们的鱼皮可以吃，所以在食用之前可以只将这些鱼鳞去掉。
无磷鱼和有鳞鱼是通过鱼鳞来区分鱼类的方法分出的两种鱼类。其中，无磷鱼指的是天生鱼鳞已经退化，也就是没有鱼鳞的鱼类，以及鱼鳞很小的品种。从这个描述来看，无磷鱼并不仅仅指的是完全没有鱼鳞的鱼类，还包括鱼鳞小的。上面已经介绍过，为了适应周围的环境，金枪鱼在长期进化的过程中鱼鳞已经退化了，变成了很小的圆鳞。因此，可见金枪鱼也属于无磷鱼。
虽然它们的鱼鳞是比较小的，不过也可以起到重要的作用。上面已经介绍过其中一个作用就是让它们的游动速度更快，更方便它们捕食。另外，这些鱼鳞还可以起到一定的保护作用，将大部分有害的细菌隔绝在金枪鱼的体外。这些鱼鳞还可以起到一定的反光作用，可以看作是一种天然的伪装手段。
