旗鱼的天敌是一些大型掠食动物,比如虎鲸、大白鲨、灰鲭鲨等。这几种鱼类都是性格非常凶猛的,而且体型较大,在海洋之中几乎算得上是没有天敌的。如果旗鱼碰到这几种鱼类,可能会有一定的危险。虽然它们能对旗鱼造成伤害,但是也不能轻易的杀死旗鱼。因为旗鱼的游动速度是比较快的,它们最快的时候可以达到190千米每小时。再加上旗鱼的攻击力也是非常强的,而且有很尖锐的吻部,它们很有可能会利用自己吻部将鲨鱼的肚子刺穿。
虽然它们的天敌不能轻易将它们杀死,但是人类捕捉旗鱼是相对简单的,所以人类也算是旗鱼的天敌。
旗鱼游泳的速度是非常快的,它们最快的速度可以达到190千米每小时,平均每小时可以达到130千米每小时,属于海洋生物中游动速度非常快的鱼类。它们之所以游动的速度比较快是因为它们的体型是扁平的,而且整体的线条比较流畅,这样的体型能使它们在水中的阻力减少,所以速度比其它鱼会快很多。