黄黝鱼和虾虎鱼的外观比较相似，许多人都无法区分它们。它们的确长得比较像，它们是近亲。不过，它们也有一定的差别，主要体现在以下几个方面：
1、性情：黄黝鱼和虾虎鱼在性情方面有一定的差别。黄黝鱼虽然体型比较小，不过它们是比较凶的，具有攻击性。但虾虎鱼相比较起来性情会好一些，它们不太爱活动，平时不容易爱跟其它的鱼发生冲突。
2、体型：黄黝鱼和虾虎鱼在体型方面的差别是非常大的。黄黝鱼的体型比较小，一般来说在成年之后身体长度也不会超过4厘米。虾虎鱼的体型会稍微大一些，不过总体来看超过10厘米的不太多。某些特殊的虾虎鱼品种，它们的长度可能会达到30厘米。
3、寿命：二者的寿命长短也有一定的差别。它们是寿命最短的脊椎动物，寿命一般在2—3年，很少有能够超过4年的。有些特殊的虾虎鱼品种，寿命只有8周左右。
最好不要让黄黝鱼和虾虎鱼混养。它们的习性特点还是有差异的，放在一块养的话不容易调节周围环境。另外，它们的性情以及体型方面差异也比较大，若是放在一块养的话会有出现冲突的可能性。选择跟虾虎鱼混养的鱼时，最好用体型差不多、并且在上层活动的鱼类。
